武汉生物工程学院的本科学历认定需要结合招生省份和批次综合判断，具体说明如下：

湖北省内定位

该校是湖北省内通过教育部本科教学工作合格评估的民办普通本科高校，属于 本科批次招生，因此 通常被认定为二本大学。

全国其他省份的批次划分

- 在2016年湖北高考改革前，该校属于 本科三批（2000年升本科后至2016年改革前）。

- 自2016年起湖北将本科二批与三批合并为 本科二批，但该校因长期在二批招生，仍沿用二本定位。

- 对于非湖北考生，若所在省份仍保留分批次招生，则需参考该校在各省的招生计划批次。例如，该校在江西、广西、宁夏等省份曾属本科二批招生。

官方文件依据

教育部及湖北省教育考试院未对高校进行"一本""二本"的官方划分，这一分类属于民间根据招生批次的习惯性说法。

总结：

该校在湖北省内属于二本大学，但全国其他省份考生需结合当地招生政策判断。建议考生查询所在省份《招生专业目录》中的批次标注。