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数字pcr原理

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数字PCR(dPCR)是一种基于单分子扩增的核酸绝对定量技术,其核心原理是通过将样本分散到大量独立反应单元中,分别进行PCR扩增,并通过荧光信号统计实现高精度定量分析。以下是具体解析:

一、技术原理

单分子扩增

dPCR将含有目标核酸的样品均分为数百至数百万个微小反应单元(如油包微滴或芯片式反应室),每个反应单元中仅含有0个或1个目标DNA分子。这种设计避免了传统PCR中因引物竞争导致的扩增偏差。

泊松分布应用

每个反应单元的扩增结果呈现0(无信号)或1(有信号)的二元状态,符合泊松分布规律。通过统计阳性反应单元的数量,结合反应单元总数,可计算出目标DNA的起始浓度。

绝对定量能力

由于直接计数DNA分子,dPCR可实现样品中目标分子的绝对定量,无需依赖标准品或内标。

二、关键特点

高灵敏度:

可检测极低浓度的核酸,灵敏度比传统qPCR提高10-15倍。

抗干扰性强:

不受PCR扩增效率、引物偏差等因素影响,结果更稳定。

无需标准曲线:

通过泊松分布模型直接计算浓度,避免校准标准曲线的误差。

三、应用场景

基因组学研究:如罕见突变检测(RMD)、病毒载量分析等。

临床诊断:肿瘤标志物检测、病原体定量等。

法医学:个体识别、亲子鉴定等。

四、技术优势与挑战

优势:绝对定量精度高,适合低浓度样本分析;

挑战:设备成本较高,操作复杂度大于qPCR。

dPCR通过单分子分区和泊松分布原理,克服了传统PCR的局限性,成为核酸定量领域的重要技术。