股权溢价转让的税务处理需根据转让主体（自然人或法人）及转让方式（溢价、平价或折价）分别进行，具体如下：

一、自然人股东股权溢价转让

应纳税所得额计算

按照《个人所得税法》第6条第5款规定，自然人股权转让以转让收入减除股权原值和合理费用后的余额为应纳税所得额。仅当转让价格高于股权原值时，需缴纳个人所得税。

税率与申报

- 税率：

20%

- 申报要求：需在转让股权后60日内向税务机关申报纳税。

特殊情况处理

- 递延纳税：

可申请分期缴纳或递延至经营所得中扣除；

- 阴阳合同：通过合同差额调节转让价格以降低税负（需符合税务机关规定）。

二、法人股东股权溢价转让

企业所得税处理

法人股东转让股权属于企业资本运作，需将转让收益并入企业应纳税所得额，按企业适用税率（通常为25%）缴纳企业所得税。

印花税

股权转让合同需缴纳印花税，税率为0.5‰。

三、其他注意事项

股权原值：

包括购买价款、相关税费及合理费用（如评估费、手续费等）；

转让方式影响：平价或折价转让无需纳税，仅溢价转让产生纳税义务；

地域管辖：在股权所在企业注册地或税务机关指定地办理纳税申报。

建议转让前咨询专业税务机构，合理规划交易结构以降低税务风险。