长门的轮回眼来源存在不同说法，但综合剧情和角色设定，主要存在以下两种解释：

一、斑直接移植轮回眼

斑的死亡计划

宇智波斑为实施月之眼计划，需通过轮回眼复活。他需找到漩涡一族后裔承载轮回眼，而长门正是漩涡一族远亲，且其体内拥有特殊查克拉（漩涡一族查克拉可强化轮回眼能力）。

移植方式

- 直接移植：

一种说法是斑在临死前直接将轮回眼移植给长门。

- 间接移植：另一种说法是通过中间人（如带土）完成移植，但带土因缺乏仙人细胞无法使用轮回眼，最终由斑完成。

二、轮回眼与生俱来

部分剧情暗示长门可能因大筒木一族血统天生拥有轮回眼：

长门是大筒木一族后裔，该族天生具备轮回眼能力；

但漩涡一族的查克拉特性（如封印尾兽能力）可能强化了轮回眼的威力。

共同点与争议

两种说法都认可斑在轮回眼传承中的核心作用；

轮回眼赋予长门外道·轮回天生之术、创世与灭世能力，成为其成为英雄的关键。

总结：长门的轮回眼主要来源于斑的移植，但具体过程（直接或间接）及是否与生俱来，剧情中并未明确说明，两种说法均存在合理性。