一级主任科员和二级主任科员都属于正科级别，但存在一些区别，主要体现在以下几个方面：

职务与职级的区别

一级主任科员通常称为“大正科”，而二级主任科员称为“小正科”。一级主任科员对应实职正科级的最高级，而二级主任科员对应实职正科级的最低级。

工资待遇

基本工资：一级主任科员的职级工资为1780元/月，二级主任科员为1570元/月，两者相差210元/月。在级别工资方面，一级主任科员对应的级别从二十一级至十五级，最低1831元，最高5435元；二级主任科员对应的级别从二十二级至十六级，最低1705元，最高5075元，通常每月差距在100元左右。

津贴和补贴：虽然全国没有统一标准，但在同一地区，一级主任科员和二级主任科员的标准是一样的，部分津补贴如车补、物业、通讯等标准相同，但由于一级主任科员职级更高，部分津补贴标准略有不同，月差额约100元上下。

奖金：年度考核称职以上的奖金（十三薪）和考核优秀的嘉奖金额相差不大，但目标责任制考核奖的系数可能会有所不同，导致一定的收入差距。

公积金：因缴费基数不同，一级主任科员和二级主任科员在公积金方面存在细小的差异。

晋升路径

一级主任科员主要有两种晋升渠道：一种是由纯职级的二级主任科员晋升而来，另一种是实职正科级干部晋升而来。前者多存在于省直以上机关，后者多存在于市直以下机关。

职责与权力

一级主任科员和二级主任科员虽然都属于正科级，但并不具备领导职责和权力。一级主任科员在职级序列中处于中间部位，扮演着承上启下的角色，而二级主任科员则相对较低一级。

其他待遇

在市直机关中，即使不担任领导职务的公务员，也有机会晋升为一级主任科员，其工资甚至可能超过科长。

综合来看，一级主任科员和二级主任科员在职务与职级、工资待遇、晋升路径和其他待遇方面存在一定差异，但都属于正科级干部，具备一定的职业发展空间和待遇优势。