李兰娟院士未入选共和国勋章的原因可从以下两方面综合分析：

一、官方评选机制与名额限制

评选标准严格

共和国勋章的评选遵循“功绩卓越、时代楷模、社会影响”的标准，且名额稀缺，仅授予在特定领域（如抗疫）作出“巨大贡献”的个人。

荣誉体系层级性

即使未获勋章，李兰娟院士仍获“全国抗击新冠肺炎疫情先进个人”称号，并提名国家科技进步奖，其学术与抗疫贡献均得到权威认可。

二、社会评价与个人选择

主动放弃提名

有推测称李兰娟院士可能主动放弃勋章提名，认为抗疫一线的基层工作者和牺牲者更需这份荣誉。

功绩归属认知

她强调，抗疫是团队合作的结果，将荣誉让渡给在前线牺牲的同事，体现了其高尚的奉献精神。

补充说明

李兰娟院士在疫情初期提出武汉封城建议，为控制疫情扩散作出了关键决策，其贡献被权威媒体和公众广泛认可。未获勋章更多是出于对其他抗疫英雄的尊重，以及她个人谦逊的品质。