注释和参考文献在学术写作中有着明显的区别，主要体现在以下几个方面：

定义

参考文献：是指作者在撰写论文或论著过程中引用的其他文献，包括书籍、期刊文章、报告、网页等。参考文献的主要目的是提供证据或背景信息，支持作者的观点。

注释：是对论著正文中某一特定内容（如术语、数据、观点等）的进一步解释或补充说明。注释的目的是帮助读者更好地理解正文内容，提供更多的背景信息和参考资料。

内容

参考文献：列出作者在写作过程中参考的所有文献，按照一定的格式规范排版，通常包括作者姓名、出版日期、文章标题、期刊名称或书名、页码等信息。

注释：内容更加广泛，可以是对文中某个术语的解释、对某个观点或数据的来源说明、对某个历史事件的背景介绍等。注释的形式可以是脚注（作为页脚出现在每一页底部）和尾注（出现在文章的末尾）。

分类

参考文献：按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献，类型包括专著、论文集、报纸文章、期刊文章、学位论文、报告、标准、专利、论文集中的析出文献等。

注释：在中国古代分得较细，分别称之为注、释、传、笺、疏、章句等，包含的内容很广，如字词音义、时间地点、人物事迹、典故出处、时代背景等。

形式

参考文献：通常以列表的形式出现在论文的末尾，按照所采用的引用格式要求进行格式化处理，如APA、MLA、Chicago等。

注释：通常以数字加圆圈标注（如①②……）出现在正文的页面下方，有时也会出现在页脚或文末。

位置

参考文献：需要在论文中注明所引用的参考文献，通常列在论文的末尾。

注释：需要在该内容旁边或下方添加注释符号，并在文末列出版面注解来注明注释的符号及对应的注释内容。

受版权保护情况

参考文献：引用的内容受版权保护，需要在文中注明所引用的参考文献，以示对其他作者的尊重和学术诚信。

注释：注释中的文献注释与参考文献的相同点皆是提供文献出处，但注释更多的是作者自己的解释，不受版权保护。

综上所述，注释和参考文献在学术写作中虽然都是重要的补充材料，但它们的作用和用途不同。注释主要是为了帮助读者更好地理解论文中的内容，提供更多的背景信息和参考资料，而参考文献则是为了证明论文中所述内容的可信度和学术价值，同时也方便读者查阅相关资料。