基层减负过程中存在的问题主要包括以下几点：

注重表面性减负：

许多减负措施只是针对表面问题进行应对，而忽视了一些根本性和结构性的问题。例如，一些组织和机构在减负过程中只关注员工的工作量和压力，而忽视了一些制度条款的不完善和流程不顺畅等问题。因此，基层减负的效果往往只停留在短期的缓解，而无法真正解决根本问题。

减负措施缺乏科学性和系统性：

在实施基层减负措施时，很多组织和机构缺乏科学的分析和研判，只是盲目地采取一些普遍的做法。例如，一些单位会在上级要求加班的情况下，仍然要求员工按时下班。虽然这样做可能会暂时减轻员工的工作压力，但对于长期的工作安排和任务完成可能会带来一定的隐患。此外，基层减负措施往往过于零散和断片化，缺乏系统性和整体性，无法形成有效的减负体系。

管理体制存在缺陷：

在组织和机构中，存在一些管理体制上的垂直和刚性局限，这也是导致基层减负问题的原因之一。例如，一些组织和机构过分追求效率和结果，忽视了员工的生活质量和工作环境。此外，由于长期以来的管理模式和规则，一些基层员工过多地承担着管理层面的责任和工作量，导致基层减负的目标无法实现。

缺乏有效的监督和评估机制：

在实际的减负过程中，缺乏科学、合理的监督和评估机制也是导致问题产生的原因之一。

工作量大、责任重：

基层工作人员由于职责和工作性质的特殊性，常常承担着超出职责范围的各种工作任务，导致工作量过重。同时，基层工作职责涉及到群众生活的各个方面，需要承担重要社会责任和高个人责任，时间和精力压力都很大。

任务重：

基层工作任务繁重，不仅数量大，而且种类繁多，导致基层工作员能力和素质的要求很高。

收入低：

基层工作人员的收入低，生活压力大，加之房价等生活成本高，基层工作不仅看不到“真金白银”的回报，经济上很难负担自己的生活和家庭开支。

基层环境恶劣：

基层单位存在卫生、环境实际操作中的问题，如公共设施不足，工作环境噪音、恶臭、潮湿等，这些问题会影响基层工作者的情绪和工作效率。

思维观念的定势性：

受长期以来形式主义、文山会海痕迹管理等观念的影响，基层干部在减负工作思想上有顾虑，行动上放不开，仍然存在痕迹管理作为随时应对上级相关部门可能检查的准备。

督查蜕变的隐匿性：

名目繁多的督导检查逐渐减少，但调研指导工作逐渐增加，“调研结果”影响绩效考核成为上级部门和基层干部的共识，督导检查逐渐蜕变为一些不必要的调研指导。

目标管理的冲突性：

基层工作本身的特性决定了减负与留痕、目标与管理的复杂性、冲突性。部分基层工作目标存在一定的模糊性、多样性，相关工作是否开展、开展质量好不好，很大程度上需要通过软件资料、痕迹管理来进行评价。

缺乏权责明确、过分追求数据：

一些地方过分强调绩效评价，导致基层干部在工作时更注重量化指标而忽略了获得更好结果所需的客观条件。有些地对数据驱动也理解偏差，注重整改案头文件、检查报表、进行形式主义地“应政策”等行为，而较少注重真正解决基层实际问题。

行政事务繁琐、程序复杂：

一些地方由于过分追求规范和制度，导致行政事务繁琐、程序复杂并耗费大量时间。

资金分配不合理、财务管理不规范：

在一些地方，由于资金分配机制和财务管理存在缺陷，基层单位经费紧张、使用困难。

人才培养和选拔机制不健全：

现阶段，基层干部队伍中普遍缺乏高素质、专业化的人才。这与基层干部的选拔机制及培训体系的不健全有关。

过多的会议和报告：

基层减负中仍然存在的一个主要问题是过多的会议和报告。许多基层干部抱怨，他们需要花费大量的时间参加各种各样的会议，填写繁多的报告。

过多的行政审批和手续：

另一个存在的问题是过多的行政审批和手续。在基层工作中，各种各样的审批手续和手续常常变成了基层工作的一大负担。

同一任务重复安排：

基层减负过程中的一个主要问题就是同一任务重复安排。由于上级政府部门对下级单位的要求和指示缺乏耦合度，往往造成了同一个任务在不同部门之间反复交接、反复承担，导致了工作效率低下和资源浪费。

资源和人才短缺：

资源和人才的短缺是基层减负中另一个突出的问题。由于资源与人力本身就相对紧缺，地方政府往往无法提供足够的支持。

政策落地难：

政策落地难是基层减负过程中常见的挑战之一。尽管中央政府发布了一系列减负政策