天猫旗舰店和专营店的主要区别体现在品牌授权范围、经营资质和运营限制等方面，具体对比如下：

一、品牌授权范围

旗舰店

- 必须以自有品牌（商标为R或TM状态）入驻，或获得品牌方排他性授权。

- 若经营多个品牌，需满足天猫主动邀请入驻条件（如卖场型品牌）。

专营店

- 可同时经营同一类目下的两个及以上品牌，包括自有品牌和他人授权品牌。

- 若经营自有品牌，需提供商标注册证；若经营他人品牌，需提供完整的经销授权书。

二、经营资质要求

旗舰店

- 经营主体需为自有品牌企业（商标需注册或受理）。

- 需通过天猫严格资质审核，对品牌方要求较高。

专营店

- 经营主体需为在中国注册的企业法人。

- 需提供品牌授权证书，他人品牌需授权书可追溯至品牌方。

三、运营限制与费用

旗舰店

- 范围限制：同一类目下可经营所有产品，或同一实际控制人下的多个自有品牌。

- 费用：保证金5万（R标）或10万（TM标），年费已随政策调整取消。

- 优势：消费者信任度高，活动参与度更广，受假货风险较低。

专营店

- 范围限制：同一类目下可混搭多个品牌，但需为每个品牌单独申请授权。

- 费用：保证金10万（R标）或15万（TM标），年费3-6万。

- 劣势：需管理多个品牌授权，运营复杂度较高。

四、其他差异

旗舰店：

更注重品牌形象展示，装修和营销资源倾斜更多。

专营店：灵活性较高，适合多品牌联营策略。

总结：旗舰店适合专注自有品牌、追求品质与信任的商家；专营店适合已积累多品牌资源、希望降低运营门槛的商家。选择时需结合品牌战略、资金实力及长期规划。