根据现有信息，郑强离婚的主要原因可归纳为以下几点：

妻子出轨且长期分居

郑强妻子被曝光婚内出轨并包养情妇，且两人长期分居。郑强在妻子求复合时选择拒绝，表明他无法原谅妻子的背叛行为。

长期分居导致感情疏离

郑强与妻子分居期间，他接触到了一位年轻女助理，后者给予了他情感关怀。这段关系让郑强意识到，即使没有妻子出轨的明确证据，长期分居本身也可能导致感情变质和自我迷失。

现实考量与自我保护

郑强在离婚协议中选择将房产留给孩子，存款对半分配，体现了他对家庭责任的考量。同时，他可能也希望通过这种方式保护孩子免受情感创伤。

综上，郑强离婚的核心原因是无法原谅妻子的出轨行为，以及长期分居对感情的破坏。这一决定虽令妻子悔恨，但已无法挽回婚姻关系。