高新技术企业认定的流程主要包括以下几个步骤：

企业自我评价及申请

企业首先需要对照《高新技术企业认定管理办法》进行自我评价，认为符合认定条件的，可以在“高新技术企业认定管理工作网”进行注册登记，并向认定机构提出认定申请。

申请时需要提交的材料包括：

高新技术企业认定申请书；

企业营业执照副本、税务登记证（复印件）；

知识产权证书（独占许可合同）、生产批文、新产品或新技术证明（查新）材料、产品质量检验报告、省级以上科技计划立项证明及其他相关证明材料；

企业职工人数、学历结构以及研发人员占企业职工的比例说明；

经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用情况表（实际年限不足三年的按实际经营年限），并附研究开发活动说明材料；

经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）以及技术性收入的情况表；

近三个会计年度企业所得税年度纳税申报表。

专家评审

认定机构应在符合评审要求的专家中，随机抽取组成专家组。专家组对企业申报材料进行评审，提出评审意见。

审查认定

认定机构结合专家组的评审意见，对申请企业进行综合审查，提出认定意见并报领导小组办公室。认定企业由领导小组办公室在“高新技术企业认定管理工作网”公示10个工作日，无异议的，予以备案，并在“高新技术企业认定管理工作网”公告，由认定机构向企业颁发统一印制的“高新技术企业证书”；有异议的，由认定机构进行核实处理。

公示与备案

经认定的高新技术企业在“高新技术企业认定管理工作网”上公示15个工作日，没有异议的，报送领导小组办公室备案，并在“高新技术企业认定管理工作网”上公告认定结果，并向企业颁发统一印制的“高新技术企业证书”。

建议企业在申请高新技术企业认定时，确保所有材料的准确性和完整性，并按照流程逐步进行，以提高认定成功率。同时，企业应关注认定政策的变化，及时更新申请材料。